Styrelsen består av 7-13 personer som väljs av Fullmäktige (FuM) vid FuM:s konstituerande sammanträde. Styrelsen ansvarar inför FuM och bereder ärenden som skall behandlas av FuM. Föreningens ordförande för närmast föregående verksamhetsår, Inspektor, utskottsordföranden och revisorerna är kallade och adjungerade till alla styrelsemöten. Vid sina möten kan styrelsen även adjungera medlemmar och övriga personer som styrelsen anser bör vara närvarande vid behandlingen av en viss fråga.
Styrelsen leds av Presidiet, som består av ordförande och vice ordförande för Medicinska Föreningen. De har, i korta ordalag, till uppdrag att representera Medicinska Föreningen och föra dess talan. De ska också se till att beslut som fattas av Fullmäktige och Styrelsen blir genomförda.